ANALISIS FILOGENETIKA ISOLAT BAKTERI AEROMONAS HYDROPHILA DARI IKAN SEHAT MENGGUNAKAN GEN 16s rRNA

Maesaroh, (2013) ANALISIS FILOGENETIKA ISOLAT BAKTERI AEROMONAS HYDROPHILA DARI IKAN SEHAT MENGGUNAKAN GEN 16s rRNA. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

Abstract

Aeromonas hydrophila umum dijumpai pada ekosistem perairan dan mempunyai peranan sebagai microbial flora bagi organisme air pada kondisi lingkungan yang stabil dan dapat menjadi patogen pada ikan saat kondisi kualitas air yang buruk. Aeromonas memiliki taksonomi yang kompleks dengan karakter yang berbeda-beda, bahkan dilevel intraspesies. Tujuan penelitian ini yaitu untuk melihat kekerabatan bakteri A. hydrophila yang diisolasi dari beberapa ikan sehat dan menggambarkan potensi patogen setiap A.hydrophila yang didapat sehingga dapat dijadikan sebagai landasan awal dalam pengontrol perkembangan jangkitan penyakit pada ikan. Pada penelitian ini dilakukan pengujian morfologi dan biokimia untuk menskrining sampel bakteri yang diisolasi dari beberapa intestin ikan sehat (mas, gurame, lele, nila, dan tawes). Selain itu, dilakukan pengujian molekuler yaitu pendeteksian gen lip sebagai gen spesifik A. hydrophila, gen 16S rRNA, dan pendeteksian gen virulen (act, aerA, aopB, alt, ast, aexT, dan ascV) untuk mengetahui keberadaan gen-gen virulen pada setiap strain A. hydrophila. Hasil skrining dengan pengujian morfologi, biokimia, dan molekuler, dari 46 isolat bakteri yang didapat, hanya 8 isolat bakteri yang kemungkinan besar merupakan A. hydrophila. Kedelapan isolat tersebut merupakan bakteri gram negatif dengan bentuk basil, positif terhadap uji oksidase, merupakan bakteri fakultatif anaerob, bersifat motil dan memiliki kemampuan β hemolisis. Hasil dari pendeteksian gen lip pada seluruh isolat A. hydrophila, 60% isolat menunjukkan amplikon pada ukuran 760 pb. Sedangkan hasil dari analisis bioinformatika menggunakan sikuen gen 16S rRNA menunjukan kedelapan isolat bakteri tersebut berkerabat dekat satu dengan yang lainnya dan dengan A. hydrophila ATCC 7966. Pendeteksian gen virulen menunjukkan bahwa seluruh isolat dimungkinkan tidak memiliki sifat patogen pada ikan.

Kata kunci : Aeromonas hydrophila, gen 16S rRNA, filogenetika, gen virulen.

Preview	Text S_BIO_0905752_Title.pdf Download (382kB) | Preview
Preview	Text S_BIO_0905752_Abstract.pdf Download (214kB) | Preview
Preview	Text S_BIO_0905752_Table of Content.pdf Download (155kB) | Preview
Preview	Text S_BIO_0905752_Chapter1.pdf Download (157kB) | Preview
	Text S_BIO_0905752_Chapter2.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (272kB)
Preview	Text S_BIO_0905752_Chapter3.pdf Download (372kB) | Preview
	Text S_BIO_0905752_Chapter4.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (653kB)
Preview	Text S_BIO_0905752_Chapter5.pdf Download (202kB) | Preview
Preview	Text S_BIO_0905752_Bibliography.pdf Download (255kB) | Preview
	Text S_BIO_0905752_Appendix.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (934kB)

Item Type:	Thesis (S1)
Subjects:	Universitas Pendidikan Indonesia > Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Program Studi Biologi - S1 > Program Studi Biologi (non kependidikan)
Divisions:	Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Program Studi Biologi - S1 > Program Studi Biologi (non kependidikan)
Depositing User:	DAM STAF Editor
Date Deposited:	18 Oct 2013 01:41
Last Modified:	18 Oct 2013 01:41
URI:	http://repository.upi.edu/id/eprint/2353

Actions (login required)

View Item