KARAKTERISASI PUSTAKA GENOM MIKROSATELIT PADA GURAME (OSPHRONEMUS GOURAMY LAC.) SKRIPSI

Guntur Eka Satya Putra, - (2010) KARAKTERISASI PUSTAKA GENOM MIKROSATELIT PADA GURAME (OSPHRONEMUS GOURAMY LAC.) SKRIPSI. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

Abstract

Telah dilakukan pembuatan pustaka genom dan karaterisasi pustaka genom mikrosatelit pada ikan gurame (Osphronemus gouramy) dengan menggunakan penanda mikrosatelit. Potongan-potongan DNA yang kaya akan motif mikrosatelit di amplifikasi dengan alat PCR. Selanjutnya amplikon di ligasi kedalam vektor pGEM-T easy. Empat puluh koloni putih yang mengandung plasmid rekombinan dari total 1321 koloni putih yang dipilih secara acak untuk di sikuensing. Hasil sikuensing menunjukkan 32 sikuen (80%) mengandung mikrosatelit, yang kemudian dikelompokan atas dasar pengelompokan Weber (1990), Diperoleh motif-motif mikrosatelit yang sangat berpotensi dijadikan primer antara lain: GCTT)10, (GCT)10 , (GAA)13., (TAA)10, (GGT)10, (CCT)10, (TTA)5TT(TTA)4, (GCT)9(TA)6, (GCA)5(GTG)7, (GCT)9(TA)6,(CCA)8(TCA)2, dan (GA)4G(TTTC)5. .Motif-motif mikrosatelit yang berpotensi antara lain: (TTA)6 (CTT)5, (GTA)5, (GGA)6, (GGA)5, (GGT)5, (GA)3G(GA)4G(GA)2, (CCA)4(TCA)3(CCA)2, (TT)5(TTA)3, (CA)5(GTT)5, (GAT)3(GGT)5TC(GT)4, (GCG)3G(GCG)5(A)5, (TTA)5TT(TTA)4, dan (GGT)4GT(GGT). Motif-motif mikrosatelit yang berpotensi rendah antara lain: CA)8, (GT)5, (TA)6, (CA)8, (CT)6, (CCT)2CA(CCT)2. (TA)3(CT)2. (CA)4(CT)4. (C)3(A)2(C)10(A)2. (GA)3GCA(CAGA)2, dan (GT)9A(GA)3. Proses perancangan primer dengan menggunakan perangkat komputer Primer 3 didapatkan 37 pasang primer yang berpotensi digunakan untuk melihat keragaman genetik pada gurame.

Baca Full Text klik disini
[img] Text
s_bio_022574_table_of_content.pdf
Download (259kB)
[img] Text
s_bio_022574_chapter1.pdf
Download (259kB)
[img] Text
s_bio_022574_chapter2.pdf
Restricted to Staf Perpustakaan
Download (340kB)
[img] Text
s_bio_022574_chapter3.pdf
Download (374kB)
[img] Text
s_bio_022574_chapter4.pdf
Restricted to Staf Perpustakaan
Download (1MB)
[img] Text
s_bio_022574_chapter5.pdf
Download (242kB)
[img] Text
s_bio_022574_bibliography.pdf
Download (270kB)
Official URL: http://repository.upi.edu
Item Type: Thesis (S1)
Additional Information: ID SINTA Dosen Pembimbing R KUSDIANTI: 6041647 DIAH KUSUMAWATY: 6005459
Uncontrolled Keywords: Osphronemus gouramy, gurame, mikrosatelit.
Subjects: L Education > L Education (General)
Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
Divisions: Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Program Studi Biologi - S1
Depositing User: Hikmal Fajar Fardyan
Date Deposited: 12 Sep 2023 09:51
Last Modified: 12 Sep 2023 09:51
URI: http://repository.upi.edu/id/eprint/104974

Actions (login required)

View Item View Item