POTENSI PENANDA SIMPLE SEQUENCE REPEAT (SSR) DALAM ANALISIS VARIASI GENETIK OSPHRONEMUS GOURAMY LAC. YANG DIINFEKSI AEROMONAS HYDROPHILA

    Arin Safrini, - (2009) POTENSI PENANDA SIMPLE SEQUENCE REPEAT (SSR) DALAM ANALISIS VARIASI GENETIK OSPHRONEMUS GOURAMY LAC. YANG DIINFEKSI AEROMONAS HYDROPHILA. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

    Abstract

    Variasi genetik DNA gurame (Osphronemus gouramy Lac.) yang diinfeksi Aeromonas hydrophila telah dianalisis menggunakan penanda DNA Simple Sequence Repeat (SSR) pada gel poliakrilamida. DNA gurame yang resisten dan sensitif terhadap A. hydrophila diamplifikasi dengan menggunakan empat macam primer SSR yaitu GE 1.b, GEb 2.4, GE 3.1 dan GE 1.3 pada suhu annealing 49,50C, dan hanya primer SSR GE 1.b dan GE 3.1 yang dianalisis lebih lanjut karena terdapat fragmen DNA yang polimorfik dan pita yang dihasilkan sebanyak 1-4 pita. Primer SSR GE 1.b merupakan primer SSR yang spesifik membedakan DNA gurame resisten dan sensitif, karena didapatkan motif ukuran larik DNA yang spesifik untuk gurame resisten pada alel atas (A) berada pada ukuran 319-328 pb (>300 pb) dan pada alel bawah (B) berukuran antara 207-284 pb (>200 pb). Sedangkan untuk sampel DNA gurame sensitif, pada alel atas (A) berada pada ukuran 293 pb (<300 pb) dan pada alel bawah (B) berukuran antara 191-196 pb (<200 pb). Hasil analisis diperoleh rataan nilai heterozigositas (H) primer SSR GE 1.b dan GE 3.1 yaitu 0,2040 dan 0,2366, dan nilai PIC 0,8490 dan 0,7676. Hasil ini menunjukkan kedua primer mempunyai variasi genetik yang cukup tinggi.

    Baca Full Text klik disini
    [thumbnail of s_d035_056198_table_of_contents.pdf] Text
    s_d035_056198_table_of_contents.pdf
    Download (250kB)
    [thumbnail of s_d035_056198_chapter1.pdf] Text
    s_d035_056198_chapter1.pdf
    Download (261kB)
    [thumbnail of s_d035_056198_chapter2.pdf] Text
    s_d035_056198_chapter2.pdf
    Restricted to Staf Perpustakaan
    Download (694kB)
    [thumbnail of s_d035_056198_chapter3.pdf] Text
    s_d035_056198_chapter3.pdf
    Download (356kB)
    [thumbnail of s_d035_056198_chapter4.pdf] Text
    s_d035_056198_chapter4.pdf
    Restricted to Staf Perpustakaan
    Download (1MB)
    [thumbnail of s_d035_056198_chapter5.pdf] Text
    s_d035_056198_chapter5.pdf
    Download (247kB)
    [thumbnail of s_d035_056198_bibliography.pdf] Text
    s_d035_056198_bibliography.pdf
    Download (262kB)
    Official URL: http://repository.upi.edu
    Item Type: Thesis (S1)
    Additional Information: ID SINTA Pembimbing: Diah Kusumawaty: 6005459 Any Aryani: 6038233
    Uncontrolled Keywords: PENANDA SIMPLE SEQUENCE REPEAT (SSR), VARIASI GENETIK OSPHRONEMUS GOURAMY LAC, INFEKSI AEROMONAS HYDROPHILA
    Subjects: L Education > L Education (General)
    Divisions: Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Program Studi Biologi - S1 > Program Studi Biologi (non kependidikan)
    Depositing User: Fawwaz Nabil Azaria
    Date Deposited: 31 Aug 2023 16:04
    Last Modified: 31 Aug 2023 16:04
    URI: http://repository.upi.edu/id/eprint/100830

    Actions (login required)

    View Item View Item