UJI AKTIVITAS PEPTIDA AKTIF RANTAI BETA FIKOSIANIN Spirulina platensis SEBAGAI KANDIDAT ANTIKANKER PAYUDARA MENGGUNAKAN PENDEKATAN IN SILICO

Trisa Sukma Nur Insani, - (2023) UJI AKTIVITAS PEPTIDA AKTIF RANTAI BETA FIKOSIANIN Spirulina platensis SEBAGAI KANDIDAT ANTIKANKER PAYUDARA MENGGUNAKAN PENDEKATAN IN SILICO. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

	Text S_KIM_1900112_Title.pdf Download (1MB)
	Text S_KIM_1900112_Chapter1.pdf Download (247kB)
	Text S_KIM_1900112_Chapter2.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (303kB)
	Text S_KIM_1900112_Chapter3.pdf Download (223kB)
	Text S_KIM_1900112_Chapter4.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (1MB)
	Text S_KIM_190012_Chapter5.pdf Download (180kB)
	Text S_KIM_1900112_Appendix.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (350kB)

Abstract

ABSTRAK Terapi berbasis peptida merupakan pendekatan baru yang menjanjikan karena peptida mampu berikatan spesifik dengan protein yang menjadi reseptornya. Fikosianin merupakan pigmen kompleks protein yang terdapat dalam jumlah dominan pada Spirulina platensis dan dilaporkan memiliki aktivitas antikanker. Namun, kajian peptida aktif fikosianin sebagai antikanker payudara masih belum banyak diteliti. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi potensi peptida dari rantai beta fikosianin sebagai kandidat antikanker payudara menggunakan pendekatan simulasi molecular docking. Simulasi dilakukan dengan menambatkan peptida aktif dari rantai beta fikosianin terhadap empat reseptor hormon kanker payudara, yaitu: 1) estrogen receptor alpha (ERα) dan progesterone receptor (PR) untuk subjenis kanker payudara reseptor hormon positif; 2) human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) untuk subjenis kanker payudara reseptor hormon negatif. Tahapan penelitian yang dilakukan meliputi: preparasi protein, validasi metode docking, optimasi dan preparasi ligan, serta simulasi docking protein-ligan. Hasil simulasi menunjukkan bahwa peptida aktif dari rantai beta fikosianin yang berpotensi sebagai kandidat antikanker yaitu DAF (Asp-Ala-Phe), GL (Gly-Leu) dan MF (Met-Phe). Adapun nilai RMSD yang dihasilkan diantaranya; 0.367Å untuk reseptor Erα, 0.858 Å untuk reseptor PR, 0,327 Å untuk reseptor HER2, mengindikasikan bahwa metode docking yang digunakan valid. Harga afinitas yang dihasilkan oleh reseptor ERα dengan peptida aktif DAF, GL, dan MF berturut-turut adalah -7,7 kkal/mol, -5,2 kkal/mol dan -6,7 kkal/mol, Adapun harga afinitas untuk reseptor PR dengan peptida aktif DAF, GL, dan MF berturut-turut adalah -7,6 kkal/mol, -5,5 kkal/mol dan -6,8 kkal/mol dan untuk reseptor HER2 dengan peptida aktif DAF, GL, dan MF didapatkan harga afinitas berturut-turut -8,4 kkal/mol, -6,6 kkal/mol dan -8,5 kkal/mol. Berdasarkan hasil penelitian, disimpulkan bahwa peptida aktif dari mikroalga Spirulina platensis berpotensi sebagai kandidat antikanker. Kata Kunci: Spirulina platensis , molecular docking, fikosianin, antikanker ABSTRACT Peptide-based therapy has offered a promising new approach since peptides are bind specifically to their receptor proteins. Phycocyanin is a protein complex pigment that abundantly available in Spirulina platensis and is reported to have anticancer activity. However, the study of phycocyanin active peptides as anti-breast cancer has not been widely studied. This study aimsto predict the bioactivity of peptides derived from phycocyanin beta chains as breast anticancer candidates using a molecular docking approach. The simulation was carried out by docking the active peptide from the phycocyanin beta chain to four breast cancer hormone receptors, namely: 1) estrogen receptor alpha (ERα) and progesterone receptor (PR) for hormone receptor-positive breast cancer subtypes; 2) human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) for hormone receptor-negative breast cancer subtypes. The stages of the research include: protein preparation, validation of the docking method, optimization and preparation of ligands, as well as simulation of protein-ligand docking. The simulation results show that the active peptides from the phycocyanin beta chain that may act as anticancer candidates are DAF (Asp-Ala-Phe), GL (Gly-Leu) dan MF (Met-Phe). The RMSD values generated include; 0.367 Å for Erα receptors, 0.858 Å for PR receptors, 0.327 Å for HER2 receptors, suggesting the method is valid. The affinity binding values of the ERα receptor with the active peptides DAF, GL, and MF are -7.7 kcal/mol, -5.2 kcal/mol, and -6.7 kcal/mol, respectively. The affinity values for the PR receptor with active peptides DAF, GL, and MF respectively -7.6 kcal/mol, -5.5 kcal/mol and -6.8 kcal/mol and for HER2 receptors with active peptides DAF, GL, and MF obtained the affinity values are -8.4 kcal/mol, -6.6 kcal/mol and -8.5 kcal/mol, respectively. All in all, it can be concluded that the active peptide from Spirulina platensis microalgae has potential as an anticancer candidate.Spirulina platensis . Keywords: Spirulina platensis , molecular docking, phycocyanin, anticancer

Item Type:	Thesis (S1)
Additional Information:	https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=0Yxu5AQAAAAJ ID Sinta Dosen Pembimbing: Vidia Afina Nuraini : 6792209 Heli Siti Halimatul Munawaroh : 5978104
Uncontrolled Keywords:	Spirulina platensis , molecular docking, fikosianin, antikanker Spirulina platensis , molecular docking, phycocyanin, anticancer
Subjects:	Q Science > Q Science (General) Q Science > QD Chemistry R Medicine > R Medicine (General)
Divisions:	Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Jurusan Pendidikan Kimia > Program Studi Kimia (non kependidikan)
Depositing User:	Trisa Sukma Nur Insani
Date Deposited:	05 Oct 2023 07:45
Last Modified:	05 Oct 2023 07:45
URI:	http://repository.upi.edu/id/eprint/109195

Actions (login required)

View Item