KARAKTERISASI PUSTAKA GENOM MIKROSATELIT PADA GURAME (OSPHRONEMUS GOURAMY LAC.) SKRIPSI

Guntur Eka Satya Putra, - (2010) KARAKTERISASI PUSTAKA GENOM MIKROSATELIT PADA GURAME (OSPHRONEMUS GOURAMY LAC.) SKRIPSI. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

	Text s_bio_022574_table_of_content.pdf Download (259kB)
	Text s_bio_022574_chapter1.pdf Download (259kB)
	Text s_bio_022574_chapter2.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (340kB)
	Text s_bio_022574_chapter3.pdf Download (374kB)
	Text s_bio_022574_chapter4.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (1MB)
	Text s_bio_022574_chapter5.pdf Download (242kB)
	Text s_bio_022574_bibliography.pdf Download (270kB)

Abstract

Telah dilakukan pembuatan pustaka genom dan karaterisasi pustaka genom mikrosatelit pada ikan gurame (Osphronemus gouramy) dengan menggunakan penanda mikrosatelit. Potongan-potongan DNA yang kaya akan motif mikrosatelit di amplifikasi dengan alat PCR. Selanjutnya amplikon di ligasi kedalam vektor pGEM-T easy. Empat puluh koloni putih yang mengandung plasmid rekombinan dari total 1321 koloni putih yang dipilih secara acak untuk di sikuensing. Hasil sikuensing menunjukkan 32 sikuen (80%) mengandung mikrosatelit, yang kemudian dikelompokan atas dasar pengelompokan Weber (1990), Diperoleh motif-motif mikrosatelit yang sangat berpotensi dijadikan primer antara lain: GCTT)10, (GCT)10 , (GAA)13., (TAA)10, (GGT)10, (CCT)10, (TTA)5TT(TTA)4, (GCT)9(TA)6, (GCA)5(GTG)7, (GCT)9(TA)6,(CCA)8(TCA)2, dan (GA)4G(TTTC)5. .Motif-motif mikrosatelit yang berpotensi antara lain: (TTA)6 (CTT)5, (GTA)5, (GGA)6, (GGA)5, (GGT)5, (GA)3G(GA)4G(GA)2, (CCA)4(TCA)3(CCA)2, (TT)5(TTA)3, (CA)5(GTT)5, (GAT)3(GGT)5TC(GT)4, (GCG)3G(GCG)5(A)5, (TTA)5TT(TTA)4, dan (GGT)4GT(GGT). Motif-motif mikrosatelit yang berpotensi rendah antara lain: CA)8, (GT)5, (TA)6, (CA)8, (CT)6, (CCT)2CA(CCT)2. (TA)3(CT)2. (CA)4(CT)4. (C)3(A)2(C)10(A)2. (GA)3GCA(CAGA)2, dan (GT)9A(GA)3. Proses perancangan primer dengan menggunakan perangkat komputer Primer 3 didapatkan 37 pasang primer yang berpotensi digunakan untuk melihat keragaman genetik pada gurame.

Item Type:	Thesis (S1)
Additional Information:	ID SINTA Dosen Pembimbing R KUSDIANTI: 6041647 DIAH KUSUMAWATY: 6005459
Uncontrolled Keywords:	Osphronemus gouramy, gurame, mikrosatelit.
Subjects:	L Education > L Education (General) Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
Divisions:	Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Jurusan Pendidikan Biologi
Depositing User:	Hikmal Fajar Fardyan
Date Deposited:	12 Sep 2023 09:51
Last Modified:	12 Sep 2023 09:51
URI:	http://repository.upi.edu/id/eprint/104974

Actions (login required)

View Item