ANALISIS FILOGENETIK IN SILICO PADA GENUS PHYLLANTHUS EUPHORBIACEAE SENSU LATO BERDASARKAN DAERAH INTERNAL TRANSCRIBED SPACER

Andri Kurniawan, - (2011) ANALISIS FILOGENETIK IN SILICO PADA GENUS PHYLLANTHUS EUPHORBIACEAE SENSU LATO BERDASARKAN DAERAH INTERNAL TRANSCRIBED SPACER. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

[img] Text
s_bio_0608210_table_of_content.pdf

Download (249kB)
[img] Text
s_bio_0608210_chapter1.pdf

Download (267kB)
[img] Text
s_bio_0608210_chapter2.pdf
Restricted to Staf Perpustakaan

Download (318kB)
[img] Text
s_bio_0608210_chapter3.pdf

Download (333kB)
[img] Text
s_bio_0608210_chapter4.pdf
Restricted to Staf Perpustakaan

Download (481kB)
[img] Text
s_bio_0608210_chapter5.pdf

Download (247kB)
[img] Text
s_bio_0608210_bibliography.pdf

Download (257kB)
Official URL: http://repository.upi.edu

Abstract

Phyllanthus merupakan salah satu genus tumbuhan yang terdistribusi secara luas di daerah tropis dan sub-tropis. Beberapa penelitian menyatakan bahwa beberapa species dari Phyllanthus memiliki kemampuan farmakologis. Analisis filogenetik berdasarkan urutan basa daerah Internal Transcribed Spacer (ITS) secara In silico telah dilakukan untuk mengetahui hubungan kekerabatan antar species dalam genus Phyllanthus. Selain itu, analisis ini pun bertujuan untuk mengetahui status filogeni dari genus Phyllanthus. Sebanyak 83 data sikuen DNA daerah ITS dari Genbank digunakan dalam analisis ini. Ke-83 data sikuen tersebut terdiri dari 72 species dari genus Phyllanthus ditambah enam data sikuen dari varian species P. niruri dan lima spesies yang dipilih sebagai outgroup yang masih merupakan anggota familia Euphorbiaceae. Seluruh data sikuen disejajarkan dengan program ClustalX kemudian diperiksa secara manual dengan bantuan program BioEdit. Hasil penyejajaran dipakai untuk membangun pohon filogenetik dengan bantuan program PAUP (Phylogeny Analysis of Using Parsimony). Pohon filogeni yang terbentuk, membagi genus Phyllanthus menjadi 13 kelompok kecuali P. maderaspetensis yang tidak masuk ke kelompok manapun dan menunjukan bahwa genus Phyllanthus termasuk golongan non-monofiletik.

Item Type: Thesis (S1)
Additional Information: ID SINTA Dosen Pembimbing TOPIK HIDAYAT: 256954 DIAH KUSUMAWATY: 6005459
Uncontrolled Keywords: FILOGENETIK IN SILICO, GENUS PHYLLANTHUS EUPHORBIACEAE SENSU LATO, DAERAH INTERNAL TRANSCRIBED SPACER.
Subjects: L Education > L Education (General)
Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
Divisions: Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Jurusan Pendidikan Biologi > Program Studi Biologi (non kependidikan)
Depositing User: Hikmal Fajar Fardyan
Date Deposited: 16 Sep 2023 15:41
Last Modified: 16 Sep 2023 15:41
URI: http://repository.upi.edu/id/eprint/105687

Actions (login required)

View Item View Item