Khansa Biantari Alika, - (2022) SKRINING POTENSI SENYAWA BIOAKTIF IKAN SIDAT (ANGUILLA BICOLOR BICOLOR) SEBAGAI IMUNOMODULATOR MENGGUNAKAN PENDEKATAN IN SILICO. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.
Abstract
Dalam kehidupan sehari-hari, manusia terpapar patogen berbahaya dan polutan lingkungan yang dapat mempengaruhi status kesehatan dan homeostasis tubuh. Namun, ketersediaan antibodi tidak menjamin bahwa tubuh akan terlindungi karena dapat terjadinya ketidakseimbangan respon imun, sehingga dikembangkan kelas molekul tertentu yang secara keseluruhan disebut imunomodulator. Spektrum bioaktivitas peptida organisme laut yang luas memiliki potensi nutraceutical dan nilai obat tinggi. Ikan sidat (Anguilla bicolor bicolor) mengandung berbagai potensi sebagai senyawa bioaktif yang belum diketahui keterlibatannya dalam mekanisme kekebalan tubuh. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi aktivitas senyawa bioaktif dariikan sidat secara in silico khususnya sebagai imunomodulator yang mampu mengaktifkan dan meningkatkan sistem kekebalan tubuh. Identifikasi potensi senyawapada ikan sidat dilakukan melalui penambatan molekuler terhadap protein gen MAPK3, SRC, MAPK1, dan AKT1 yang diperoleh melalui konstruksi jaringan protein-protein dengan Cytoscape 3.8.2. Orabilitas senyawa sebagai kandidat obat didapatkan dengan aturan “Lipinski Rule of Five”. Nilai afinitas pengikatan tertinggi pada MAPK3, SRC, MAPK1, dan AKT1 ditunjukkan berturut-turut oleh Uridine-5- Monophosphate dengan nilai -7.3 kkal/mol, All-Trans-Retinal dengan nilai -8 kkal/mol, All-Trans-Retinal dengan nilai -8.4 kkal/mol, dan Chenodeoxycholic Acid 3-Sulfate dengan nilai -7.1 kkal/mol. Seluruh senyawa kecuali Cholesteryl Sulfate memenuhi aturan “Lipinski Rule of Five”. Kandidat senyawa berhasil tertambat dengan berikatan pada sisi aktif protein dan memodulasi aktivasi jalur persinyalan protein MAPK3, SRC, MAPK1, dan AKT1 dalam mempertahankan kesehatan sistem kekebalan tubuh sebagai dasar dari skrining senyawa sebagai pengembangan obat imunomodulator. In daily life, humans are exposed to harmful pathogens and environmental pollutants that can affect health and homeostasis of the body. However, the availability of antibodies does not guarantee that the body will be protected because there could be a balance of immune responses, therefore a certain class called immunomodulators is developed. A wide spectrum of marine organism peptide bioactivity has high nutraceutical potential and medicinal value. Eel (Anguilla bicolor bicolor) has a lot of potential as bioactive compounds whose involvement in the immune mechanism is not yet known. This study aims to identify the activity of bioactive compounds from eel through in silico methods, especially as an immunomodulator to activate and enhance the immune system. Identification of potential compounds in eel was carried out by molecular docking of MAPK3, SRC, MAPK1 and AKT1 gene proteins which obtained by constructing a protein-protein network using Cytoscape 3.8.2. The orability of compounds as drug candidates were obtained by “Lipinski Rule of Five”. The highest binding affinity values for MAPK3, SRC, MAPK1, and AKT1 are shown by Uridine- 5-Monophosphate -7.3 kcal/mol, All-Trans-Retinal -8 kcal/mol, All-Trans-Retinal -8.4 kcal/mol, and Chenodeoxycholic Acid 3-Sulfate -7.1 kcal/mol. All compounds except Cholesterol Sulfate meet the “Lipinski Rule of Five” criterias. The candidate compounds successfully bind to the active site of protein targets and modulate the activation of MAPK3, SRC, MAPK1, and AKT1 proteins signaling pathways in maintaining the immune system as the the development of immunomodulatory drugs.
|
Text
S_BIO_1803863_Title.pdf Download (687kB) | Preview |
|
|
Text
S_BIO_1803863_Chapter1.pdf Download (123kB) | Preview |
|
![[img]](http://repository.upi.edu/style/images/fileicons/text.png) |
Text
S_BIO_1803863_Chapter2.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (199kB) |
|
|
Text
S_BIO_1803863_Chapter3.pdf Download (192kB) | Preview |
|
|
Text
S_BIO_1803863_Chapter4.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (3MB) |
|
|
Text
S_BIO_1803863_Chapter5.pdf Download (98kB) | Preview |
|
|
Text
S_BIO_1803863_Appendix.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (914kB) |
| Item Type: | Thesis (S1) |
|---|---|
| Additional Information: | Link Google Scholar Dosen Pembimbing Diah Kusumawaty: https://scholar.google.com/citations?user=PHUbHM4AAAAJ&hl=en&oi=ao Any Aryani: https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=wLgZSDkAAAAJ ID SINTA Scholar Dosen Pembimbing Diah Kusumawaty: 6005459 Any Aryani: 6038233 |
| Uncontrolled Keywords: | Anguilla bicolor bicolor, penambatan molekuler homeostasis, imun, imunomodulator, pengembangan obat |
| Subjects: | L Education > L Education (General) Q Science > QH Natural history > QH301 Biology |
| Divisions: | Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Program Studi Biologi - S1 > Program Studi Biologi (non kependidikan) |
| Depositing User: | Khansa Biantari Alika |
| Date Deposited: | 06 Sep 2022 04:03 |
| Last Modified: | 06 Sep 2022 04:03 |
| URI: | http://repository.upi.edu/id/eprint/77620 |
Actions (login required)
 |
View Item |