Nisa Sholihatul Ummah, - (2022) PERANCANGAN PRIMER DAN DETEKSI CpG ISLAND SECARA IN SILICO PADA GEN HSP90 AYAM (Gallus gallus). S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.
|
Text
S_BIO_1703301_Title.pdf Download (630kB) | Preview |
|
![[img]](http://repository.upi.edu/style/images/fileicons/text.png) |
Text
S_BIO_1703301_Chapter 1.pdf Download (354kB) |
|
|
Text
S_BIO_1703301_Chapter 2.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (707kB) |
|
|
Text
S_BIO_1703301_Chapter 3.pdf Download (439kB) |
|
|
Text
S_BIO_1703301_Chapter 4.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (817kB) |
|
|
Text
S_BIO_1703301_Chapter 5.pdf Download (389kB) |
|
|
Text
S_BIO_1703301_Appendix.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (1MB) |
Abstract
Gen HSP90 dapat dimanfaatkan sebagai marker cekaman panas pada ayam. Isoform gen HSP90 ayam terdiri dari HSP90α (HSP90AA1 dan HP90AB1) dan HSP90β (HSP90B1). Masing-masing isoform tersebut memiliki karakteristik struktur dan polimorfisme gen yang berbeda-beda serta belum banyak diteliti. Oleh sebab itu dilakukan perancangan primer dan deteksi CpG island dengan menggunakan perangkat lunak Primer3, Netprimer, dan MethPrimer secara in silico. Hasil penelitian menunjukan 24 kandidat primer pada gen HSP90AA1 (9), HSP90AB1 (10) dan HSP90B1 (5) yang dapat digunakan untuk melihat polimorfisme untuk dijadikan marker cekaman panas pada gen HSP90 ayam. Deteksi potensi CpG island dilakukan pada daerah promoter dan ekson pertama pada gen HSP90 ayam. Hal tersebut terkait metilasi yang terjadi pada daerah promoter yang mempengaruhi ekspresi gen. Deteksi CpG island menghasilkan hanya satu CpG island pada gen HSP90AA1 dan dua CpG island pada gen HSP90AB1 dan HSP90B1. Hasil penelitian ini diharapkan dapat digunakan untuk riset selanjutnya, yaitu mendapatkan ayam lokal Indonesia yang tahan terhadap cekaman panas.
| Item Type: | Thesis (S1) |
|---|---|
| Uncontrolled Keywords: | CpG island, HSP90 ayam, in silico, perancangan primer |
| Subjects: | L Education > L Education (General) Q Science > Q Science (General) Q Science > QH Natural history > QH301 Biology |
| Divisions: | Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Jurusan Pendidikan Biologi > Program Studi Biologi (non kependidikan) |
| Depositing User: | Nisa Sholihatul Ummah |
| Date Deposited: | 28 Apr 2022 02:25 |
| Last Modified: | 28 Apr 2022 02:25 |
| URI: | http://repository.upi.edu/id/eprint/70841 |
Actions (login required)
 |
View Item |