PENGEMBANGAN KODE BATANG DNA TUMBUHAN MAGNOLIOPSIDA DAN LILIOPSIDA SECARA IN SILICO BERDASARKAN SEKUEN MAT-K DARI GENOM KLOROPLAS

Denia Dwi Citra Resmi, - (2021) PENGEMBANGAN KODE BATANG DNA TUMBUHAN MAGNOLIOPSIDA DAN LILIOPSIDA SECARA IN SILICO BERDASARKAN SEKUEN MAT-K DARI GENOM KLOROPLAS. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

[img] Text
S_BIO_1704637_Title.pdf

Download (607kB)
[img] Text
S_BIO_1704637_Chapter1.pdf

Download (141kB)
[img] Text
S_BIO_1704637_Chapter2.pdf
Restricted to Staf Perpustakaan

Download (878kB)
[img] Text
S_BIO_1704637_Chapter3.pdf

Download (185kB)
[img] Text
S_BIO_1704637_Chapter4.pdf
Restricted to Staf Perpustakaan

Download (991kB)
[img] Text
S_BIO_1704637_Chapter5.pdf

Download (55kB)
[img] Text
S_BIO_1704637_Appendix.pdf
Restricted to Staf Perpustakaan

Download (1MB)
Official URL: http://repository.upi.edu

Abstract

ABSTRAK Indonesia diperkirakan memiliki 20,000 spesies tumbuhan Magnoliophyta yang ada di dunia, tetapi yang teridentifikasi baru 15.5%. Rendahnya persentase tersebut mengharuskan peneliti untuk memperoleh metode identifikasi cepat agar spesies yang belum teridentifikasi dapat dikelompokkan, minimal pada tingkat kelas. Kode batang DNA (DNA barcoding) merupakan salah satu teknik yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi spesies secara cepat. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis hubungan kekerabatan serta memperoleh kode batang DNA untuk kelas Magnoliopsida dan Liliopsida berdasarkan penanda mat-K dari genom kloroplas. Gen mat-K banyak digunakan dalam studi filogenetika kelompok tumbuhan Magnoliophyta. Penelitian ini menggunakan pendekatan in silico, karena waktu yang diperlukan relatif singkat dan murah. Rekonstruksi pohon filogenetika berdasarkan DNA mat-K menunjukkan hasil yang selaras dengan penelitian terdahulu. Pohon filogenetika yang menggunakan data molekuler menegaskan bahwa Magnoliopsida merupakan nenek moyang dari Liliopsida. Perancangan primer dilakukan setelah menganalisis hubungan filogenetika Magnoliopsida dan Liliopsida. Penelitian ini berhasil mendapatkan dua pasang primer spesifik masing-masing untuk Magnoliopsida dan Liliopsida. Primer ini nantinya dapat digunakan untuk membedakan kelompok Magnoliopsida dari Liliopsida pada kegiatan identifikasi di lapangan dan di laboratorium. Ke depan, dengan menggunakan teknik yang sama dapat dirancang primer-primer spesifik lainnya pada level takson di bawah kelas, seperti familia, marga, bahkan spesies. ABSTRACT Indonesia has been estimated contain 20,000 species of Magnoliophyta around the world. The current status of Indonesia's biodiversity shows that only 15.5% of the total flora in Indonesia has been identified. This is such a low percentage, requires researchers to obtain a rapid identification method, so that unidentified species can be grouped, at least at the level of the Magnoliopsida and Liliopsida classes. DNA barcoding is a technique that can be used to quickly identify species based on short sequences of specific regions in the genome. The purpose of this study was to analyze the relationship between Magnoliopsida and Liliopsida plants based on the mat-K marker and to obtain DNA barcodes for each of the Magnoliopsida and Liliopsida classes based on the mat-K marker. The mat-K gene is widely used in phylogenetic studies of the Magnoliophyta plant group. This study uses an in silico approach, because the time required is relatively short and inexpensive. Reconstruction of the phylogenetic tree based on mat-K DNA showed results that were in line with previous studies. The phylogenetic tree using molecular data confirms that Magnoliopsida is the ancestor of Liliopsida. The primary design was carried out after analyzing the phylogenetic relationship between Magnoliopsida and Liliopsida. This study succeeded in obtaining two pairs of specific primers for Magnoliopsida and Liliopsida, respectively. This primer can later be used to distinguish the Magnoliopsida group from Liliopsida in identification activities in the field and in the laboratory. In the future, using the same technique, other specific primers can be designed at the taxon level below the class, such as families, genera, and even species.

Item Type: Thesis (S1)
Uncontrolled Keywords: Filogenetika, Kode batang DNA, Liliopsida, Magnoliopsida, mat-K
Subjects: Q Science > QH Natural history
Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
Q Science > QK Botany
Divisions: Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Jurusan Pendidikan Biologi > Program Studi Biologi (non kependidikan)
Depositing User: Denia Dwi Citra Resmi
Date Deposited: 27 Aug 2021 04:17
Last Modified: 27 Aug 2021 04:17
URI: http://repository.upi.edu/id/eprint/64015

Actions (login required)

View Item View Item