ANALISIS KODE BATANG DNA DAERAH INTERNAL TRANSCRIBED SPACER (ITS) TANAMAN TIMUN APEL SECARA IN SILICO

    Delian Junior, - (2021) ANALISIS KODE BATANG DNA DAERAH INTERNAL TRANSCRIBED SPACER (ITS) TANAMAN TIMUN APEL SECARA IN SILICO. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

    Abstract

    Timun apel merupakan salah satu komoditas lokal hortikultura yang banyak dibudidayakan di Karawang bagian utara yaitu tepatnnya di daerah Pakis Jaya. Informasi ilmiah mengenai timun apel masih sangat terbatas, terutama pada taksonomi dan kekerabatan tanaman timun apel. Untuk mendapatkan informasi mengenai kekerabatan tanaman timun apel dapat menggunakan berupa metode identifikasi molekuler. Tujuan penelitian ini untuk menganalisis motif sekuen DNA pada tanaman timun apel untuk dikembangkan menjadi kode batang DNA. Metode dilakukan secara molekuler dengan menggunakan teknik DNA Barcoding. Berdasarkan penelitian ini dengan menggunakan analisis fenetik, melon (Cucumis melo) merupakan kerabat terdekat dengan tanaman timun apel sehingga diduga merupakan subspecies melon (Cucumis melo) yang baru. Pada hasil konsensus sekuen tanaman timun apel dapat dijadikan sebuah kode batang DNA dengan menghasilkan kandidat primer DELTOP 17. Konsensus sekuen tanaman timun apel dapat dijadikan sebuah kode batang DNA dengan menghasilkan primer DELTOP17.
    Apple cucumber is one of the local horticultural commodities that is widely cultivated in the northern part of Karawang, namely in the Pakis Jaya area. Scientific information about cucumber apples is still very limited, especially on the taxonomy and genetic relationship of cucumber apples. Information about genetic relationships in apple cucumber can use molecular identification methods. The purpose of this study was to analyze the motives of the DNA sequences in apple cucumber to be developed into DNA barcode. The method is done using the DNA barcoding technique. Based on this research using phenetic analysis, melon (Cucumis melo) the ancestors of the cucumber apple plant, so they are thought to be a new subspecies of melon (Cucumis melo). In the consensus sequences results, consensus sequences apple cucumber can be used as a DNA barcode by producing DELTOP 17 primers.

    Baca Full Text klik disini
    [thumbnail of S_BIO_1601185_Title.pdf] Text
    S_BIO_1601185_Title.pdf
    Download (497kB)
    [thumbnail of S_BIO_1601185_Chapter1.pdf] Text
    S_BIO_1601185_Chapter1.pdf
    Download (383kB)
    [thumbnail of S_BIO_1601185_Chapter2.pdf] Text
    S_BIO_1601185_Chapter2.pdf
    Restricted to Staf Perpustakaan
    Download (996kB)
    [thumbnail of S_BIO_1601185_Chapter3.pdf] Text
    S_BIO_1601185_Chapter3.pdf
    Download (3MB)
    [thumbnail of S_BIO_1601185_Chapter4.pdf] Text
    S_BIO_1601185_Chapter4.pdf
    Restricted to Staf Perpustakaan
    Download (761kB)
    [thumbnail of S_BIO_1601185_Chapter5.pdf] Text
    S_BIO_1601185_Chapter5.pdf
    Download (278kB)
    [thumbnail of S_BIO_1601185_Appendix.pdf] Text
    S_BIO_1601185_Appendix.pdf
    Restricted to Staf Perpustakaan
    Download (1MB)
    Official URL: http://repository.upi.edu
    Item Type: Thesis (S1)
    Uncontrolled Keywords: Apple Cucumber, DNA Barcoding, ITS, Consensus sequence
    Subjects: L Education > L Education (General)
    Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
    Divisions: Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Program Studi Biologi - S1 > Program Studi Biologi (non kependidikan)
    Depositing User: Delian Junior
    Date Deposited: 27 May 2021 05:06
    Last Modified: 27 May 2021 05:06
    URI: http://repository.upi.edu/id/eprint/60850

    Actions (login required)

    View Item View Item