EKSPLORASI GEN KETOSYNTHASE PADA BAKTERI ENDOFIT AKAR Vetiveria zizanioides L.

Hasbi Yusuf, - (2012) EKSPLORASI GEN KETOSYNTHASE PADA BAKTERI ENDOFIT AKAR Vetiveria zizanioides L. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

Abstract

Eksplorasi gen ketosynthase telah dilakukan pada 17 isolat bakteri endofit akar Vetiveria zizanioides L. Berdasarkan tujuannya, amplifikasi gen ketosynthase pada penelitian ini menggunakan dua pasangan primer degenerate oligonucleotide, yaitu DKF-DKR dan primer heterocyst glycolipid (HGLF dan HGLR). Untuk mendapatkan informasi terkait spesies spesifik bakteri yang terdeteksi memiliki gen ketosynthase, dilakukan juga analisis sekuens parsial gen 16S rRNA yang diamplifikasi menggunakan primer 63F dan 1387R. Sekuens parsial gen ketosynthase diperoleh melalui sequencing amplikon yang berukuran sekitar 400 dan 700 pb. Hasil amplifikasi gen ketosynthase pada 17 isolat bakteri endofit akar Vetiveria zizanioides L menunjukkan bahwa hanya lima jenis bakteri saja yang terdeteksi memiliki gen ketosynthase. Melalui analisis gen 16S rRNA dan analisis bioinformatik melalui program BLASTN, hasilnya menunjukkan bahwa jenis bakteri yang memiliki gen ketosynthase tersebut adalah Lysinibacillus sphaericus (Isolat A), Pantoea sp (Isolat H), Bacillus sp (Isolat K), Acinetobacter sp (Isolat M) dan Pseudomonas aeruginosa (Isolat O). Melalui studi filogenetik, bakteri H, M, dan O merupakan kelompok bakteri Proteobacteria yang kekerabatannya dekat dengan kelompok bakteri yang memiliki gen ketosynthase tipe I, sedangkan bakteri A (Lysinibacillus sphaericus) dan bakteri K (Bacillus sp) termasuk ke dalam kelompok bakteri Firmicutes yang dapat menghasilkan ketosynthase tipe II. Adanya pemisahan pada cabang pohon kekerabatan bakteri tersebut menunjukkan adanya evolusi gen ketosynthase pada bakteri-bakteri itu sendiri. Kata Kunci : Ketosynthase, Bakteri Endofit, 16S rRNA, Vetiveria zizanioides

	Text s_bio_0807629_table_of_content.pdf Download (221kB)
	Text s_bio_0807629_chapter1.pdf Download (254kB)
	Text s_bio_0807629_chapter2.pdf Download (420kB)
	Text s_bio_0807629_chapter3.pdf Download (295kB)
	Text s_bio_0807629_chapter4.pdf Download (798kB)
	Text s_bio_0807629_chapter5.pdf Download (202kB)
	Text s_bio_0807629_bibliography.pdf Download (282kB)

Item Type:	Thesis (S1)
Additional Information:	ID SINTA Dosen Pembimbing: Any Fitriani: 6004273 Any Aryani: 6038233
Uncontrolled Keywords:	Ketosynthase, Bakteri Endofit, 16S rRNA, Vetiveria zizanioides
Subjects:	L Education > L Education (General) Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
Divisions:	Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Program Studi Biologi - S1 > Program Studi Pendidikan Biologi
Depositing User:	Rio Muhammad Rahmatuloh
Date Deposited:	31 Oct 2023 06:43
Last Modified:	31 Oct 2023 06:43
URI:	http://repository.upi.edu/id/eprint/110135

Actions (login required)

View Item