UJI AKTIVITAS ANTIDIABETES TIPE 2 KELOMPOK SENYAWA FLOROTANIN DARI ALGA COKLAT MELALUI PENDEKATAN IN SILICO

Humairah Ansar Tohe, - (2023) UJI AKTIVITAS ANTIDIABETES TIPE 2 KELOMPOK SENYAWA FLOROTANIN DARI ALGA COKLAT MELALUI PENDEKATAN IN SILICO. S2 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia.

	Text T_KIM_2105226_Title.pdf Download (483kB)
	Text T_KIM_2105226_Chapter1.pdf Download (174kB)
	Text T_KIM_2105226_Chapter2.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (1MB)
	Text T_KIM_2105226_Chapter3.pdf Download (442kB)
	Text T_KIM_2105226_Chapter4.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (1MB)
	Text T_KIM_2105226_Chapter5.pdf Download (110kB)
	Text T_KIM_2105226_Appendix.pdf Restricted to Staf Perpustakaan Download (4MB)

Abstract

Diabetes melitus menjadi salah satu penyakit kronis yang paling umum di dunia. Penggunaan obat oral antidiabetes telah diteliti menunjukkan efek samping. Florotanin dari alga coklat merupakan senyawa bioaktif yang khas dan berpotensi menjadi alternatif penemuan kandidat obat antidiabetes. Penelitian ini bertujuan untuk menguji aktivitas antidiabetes tipe 2 kelompok senyawa florotanin dari alga coklat melalui pendekatan in silico dengan simulasi molecular docking. Melalui simulasi docking ditentukan afinitas pengikatan, interaksi molekuler, sisi pengikatan dan sifat inhibisi terhadap enzim yang berperan dalam regulasi karbohidrat yaitu enzim α-amilase, α-glukosidase, dan glukosa-6-fosfat dehidrogenase (G6DP). Pembanding yang digunakan adalah akarbosa sebagai kontrol positif inhibitor α-amilase dan α-glukosidase, serta polidatin sebagai kontrol positif inhibitor G6PD. Tahapan penelitian meliputi preparasi protein target dan ligan uji, validasi metode docking, optimasi dan preparasi ligan, proses docking, visualisasi hasil dengan menggunakan Autodock Tools 1.5.7, Autodock Vina 1.1.2, Avogadro, BIOVIA Discovery Studio 2021, dan PyMOL. Uji farmakokinetik dan toksisitas juga dilakukan terhadap senyawa turunan florotanin menggunakan situs swissADME, ProTox-II, dan pkCSM. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa senyawa turunan florotanin memiliki afinitas pengikatan yang lebih rendah terhadap enzim α-amilase dibandingkan akarbosa, lebih tinggi terhadap α-glukosidase dan G6DP. Florotanin berinteraksi dengan ketiga enzim melibatkan ikatan hidrogen, interaksi hidrofobik, dan interaksi van der Waals dan melibatkan residu asam amino yang sama dengan kontrol positif. Florotanin menginhibisi ketiga enzim secara kompetitif dengan menempati sisi pengikatan yang sama dengan substrat dan kontrol positif inhibitor. Uji farmakokinetika menunjukkan 8 dari 15 senyawa florotanin memenuhi aturan Lipinski sebagai obat aktif secara oral dan memiliki nilai farmakokinetika (absorpsi, metabolisme, distribusi, dan ekskresi) yang baik. Sedangkan uji toksisitas menunjukkan bahwa semua senyawa florotanin diprediksi aman dan tidak menyebabkan gangguan pada tubuh. Berdasarkan hasil penelitian diketahui bahwa senyawa florotanin diantaranya trifuhalol, triflorethol, fucoflorethol, dan eckol berpotensi kuat untuk dimanfaatkan sebagai kandidat obat antidiabetes tipe-2. Pengujian lanjutan secara eskperimental diperlukan untuk mendukung data simulasi yang diperoleh. Diabetes mellitus is one of the most common chronic diseases in the world. The use of oral antidiabetic drugs has been studied to show side effects. Phlorotannin from brown algae is a unique bioactive compound and has the potential to be an alternative for finding antidiabetic drug candidates. This study aims to examine the antidiabetic activity of type 2 of the florotanin compound group from brown algae through an in silico approach with molecular docking simulations. Through docking simulations, binding affinities, molecular interactions, binding sites and inhibitory properties of enzymes that play a role in carbohydrate regulation, namely α-amylase, α-glucosidase, and glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6DP) were determined. The comparators used were acarbose as a positive control for α-amylase and α-glucosidase inhibitors, and polydatin as a positive control for G6PD inhibitors. The stages of the research included preparation of target proteins and test ligands, validation of docking method, optimization and preparation of ligands, docking process, visualization of results using Autodock Tools 1.5.7, Autodock Vina 1.1.2, Avogadro, BIOVIA Discovery Studio 2021, and PyMOL. Pharmacokinetic and toxicity tests were also carried out on phlorotannin derivative compounds. The results showed that florotanin derivatives had a lower binding affinity for α-amylase than acarbose, and higher for α-glucosidase and G6DP. Florotannin interacts with the third enzyme involving hydrogen bonds, hydrophobic interactions, and van der Waals interactions and involves the same amino acid residues as the positive control. Florotanin competitively inhibited the third enzyme with the same binding site contamination as the substrate and inhibitor positive control. Pharmacokinetic tests showed that 8 out of 15 florotanin compounds complied with Lipinski's rules as orally active drugs and had good pharmacokinetic values (absorption, metabolism, distribution and excretion). Meanwhile, toxicity tests show that all phlorotannin compounds are predicted to be safe and do not cause harm to the body. Based on the research results, it is known that florotanin compounds including trifuhalol, triflorethol, fucoflorethol, and eckol have strong potential to be used as candidates for type-2 antidiabetic drugs. Further experimental testing is needed to support the simulation data obtained.

Item Type:	Thesis (S2)
Additional Information:	ID SINTA Dosen Pembimbing: Heli Siti HM : 5978104 Siti Aisyah : 5984449
Uncontrolled Keywords:	Florotanin, antidiabetes, in silico, molecular docking. Florotanin, antidiabetic, in silico, molecular docking
Subjects:	L Education > L Education (General)
Divisions:	Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Jurusan Pendidikan Kimia > Program Studi Kimia (non kependidikan)
Depositing User:	Humairah Ansar Tohe
Date Deposited:	03 Oct 2023 04:38
Last Modified:	03 Oct 2023 04:38
URI:	http://repository.upi.edu/id/eprint/108946

Actions (login required)

View Item